Le Honduras est confronté à plusieurs défis. Au niveau politique, le Honduras souffre de luttes intestines entre les groupes politiques et ceux au pouvoir, d'un manque de transparence entre les partis politiques et d'un manque de garantie des libertés fondamentales. Sur le plan économique, le pays est confronté à un défi dû à l'absence d'un cadre permettant de gérer les coûts à moyen terme et les dépenses extrabudgétaires, ainsi qu'à une hiérarchisation insuffisante des investissements. Sur le plan social, le pays a réalisé quelques progrès, notamment en matière de réduction de la pauvreté. Cependant, d’importantes inégalités persistent et le Honduras reste classé comme le pays le plus inégalitaire d’Amérique latine.

L'objectif du projet est de contribuer au Plan national de développement du Honduras dans son objectif de parvenir à un pays instruit et sain, exempt de pauvreté extrême, tout en affichant également des systèmes de protection sociale consolidés. Plus spécifiquement, le projet vise à renforcer les capacités pour une mise en œuvre plus efficace et efficiente des politiques publiques en :

• Renforcer la capacité du gouvernement du Honduras à formuler, mettre en œuvre et surveiller les politiques publiques tout en impliquant la société civile dans ces processus.
• Renforcer les mécanismes, les instruments et les compétences des institutions publiques pour assurer la stabilité et la durabilité macroéconomiques, et améliorer la qualité de la gestion des finances publiques, en favorisant sa transparence.
• Renforcer la capacité du gouvernement du Honduras et de la société hondurienne à tirer parti de l'accord d'association UE-Amérique centrale et d'autres initiatives mondiales.
• Renforcer l'appropriation et le leadership du gouvernement du Honduras dans la gestion des fonds d'aide au développement afin de respecter les engagements énoncés lors du Forum de haut niveau de Busan, avec un accent particulier sur la comptabilité mutuelle.

Le MADIGEP a amélioré les capacités de planification institutionnelle des ministères et des organismes publics tout en renforçant la gestion des finances publiques en « simplifiant le système national d'économie par l'application d'une gestion axée sur les résultats » ainsi qu'en « réformant la loi organique du budget ».

L'un des principaux objectifs du projet consiste à lutter contre les niveaux élevés de corruption dans les sphères politiques honduriennes. Selon le Indice de perception de la corruption, le Honduras se classe à la 135ème position. Par conséquent, l'une des mesures du projet a été l'adoption effective d'une « politique de bonne gouvernance et de lutte contre la corruption ».

Le projet a également stimulé les « laboratoires d'innovation citoyenne ». Ces laboratoires sont des espaces ouverts où les citoyens honduriens peuvent développer et partager des idées innovantes et relever certains des défis mentionnés ci-dessus tout en bénéficiant d'un soutien institutionnel et technique.