Honduras enfrenta varios desafíos. A nivel político, Honduras lucha contra luchas internas entre grupos políticos y otros en el poder, una falta de transparencia entre los partidos políticos y una falta de garantía de las libertades fundamentales. Económicamente, el país enfrenta el desafío de la falta de un marco para abordar los costos a mediano plazo y los gastos extrapresupuestarios, así como una priorización insuficiente de las inversiones. A nivel social, el país ha logrado algunos avances, principalmente en lo que respecta a la reducción de la pobreza. Sin embargo, todavía prevalecen importantes desigualdades y Honduras sigue clasificado como el país más desigual de América Latina.

El objetivo del proyecto es contribuir al Plan Nacional de Desarrollo de Honduras en su objetivo de lograr un país educado, saludable, libre de pobreza extrema, y al mismo tiempo exhibir sistemas de bienestar social consolidados. Más específicamente, el proyecto tiene como objetivo desarrollar la capacidad para una implementación más efectiva y eficiente de políticas públicas mediante:

• Fortalecer la capacidad del Gobierno de Honduras para formular, implementar y monitorear políticas públicas involucrando a la sociedad civil en dichos procesos.
• Reforzar los mecanismos, instrumentos y competencias de las instituciones públicas para asegurar la estabilidad y sostenibilidad macroeconómica, y mejorar la calidad de la gestión de las finanzas públicas, promoviendo su transparencia.
• Fortalecer la capacidad del Gobierno de Honduras y de la sociedad hondureña para aprovechar el Acuerdo de Asociación UE-Centroamérica y otras iniciativas globales.
• Fortalecer la apropiación y liderazgo del Gobierno de Honduras en la gestión de fondos de ayuda al desarrollo para cumplir con los compromisos establecidos en el Foro de Alto Nivel de Busan, con especial énfasis en la contabilidad mutua.

MADIGEP ha mejorado las capacidades de planificación institucional de los Ministerios y Organismos Públicos al tiempo que ha fortalecido la gestión de las Finanzas Públicas al "simplificar el sistema nacional de economía mediante la aplicación de una gestión basada en resultados", así como "reformar la Ley Orgánica de Presupuesto".

Uno de los principales objetivos del proyecto incluye combatir los altos niveles de corrupción dentro de las esferas políticas hondureñas. De acuerdo con la Índice de Percepción de la Corrupción, Honduras ocupa la posición 135. En consecuencia, una de las medidas del proyecto ha sido la adopción efectiva de una 'política de buen gobierno y lucha contra la corrupción'.

El proyecto también ha impulsado los "laboratorios de innovación ciudadana". Estos laboratorios son espacios abiertos donde los ciudadanos hondureños pueden desarrollar y compartir ideas innovadoras y abordar algunos de los desafíos antes mencionados mientras reciben apoyo institucional y técnico.